由于T-MES系统是基于预先设定的程式进行系统开发的，因此，开发此类系统成本高、效率低，并隐含着较大的风险。如过程有徽小变化，就可能导致系统不能正常运转，系统的稳定性差。具体表现在以下五个方面：
通用性差。目前市场上的T-MES系统，无论其功能多么复杂，均是针对特定的行业、特定的领域问题开发的。由于没有一定的技术规范指导，针对不同行业的MES功能基本上无法借鉴和使用，因而使得系统的开发周期长、投资大，限制了MES市场的快速发展。
可集成性弱。从技术发展角度和用户需求来看，软件结构本身应能与其它应用系统集成，做到相箱相成，相得益彰。不仅提高了企业遗产系统(legacy system)的生命周期，降低对信息系统的投入。同时，也为用户选择较为合适的各种软件提供了更大的空间。目前，某些具有集成功能的MES，虽能实现与上层事务处理和下层控制系统的集成，但也仅仅局限于某个特定的系统或功能，使得用户在选择MES产品时受到很大的制约，限制了MES软件产品的推广。
缺乏互操作性。互操作性是系统敏捷性的一个重要标志。企业采用的数据库、操作系统是异构的，在分布式生产环境下，需要从不同的MES系统中裁剪不同的功能，以满足某个特定任务的需要，实现互操作。目前T-MES墓本上没有此类功能。
重构能力差。重构能力是指系统具有随业务过程的变化进行功能配置和动态改变的能力。不同的行业、不同的企业其生产组织模式不尽相同，信息系统必须具有可重构能力，即根据不同的需求搭建相应的系统。
敏捷性差。敏捷性是所有先进制造模式的核心。在生产中表现为对市场的快速响应和对实际生产环境的应变能力，在信息系统中表现为系统的可重构、可重用和可扩展(3R特性)。对于T-MES，由于系统结构本身和采用的开发技术，一个微小的过程改变，系统就会无所适从，甚至不能正常运转。尽管如此T-MES在市场占有率1995年达到10亿美元，预计1999年达到35亿美元。
随着信息技术的发展和市场竞争的加剧，具有高度敏捷性的制造执行系统日益成为市场的热点，国际MES协会的成立为可集成MES系统的研究与开发提供了技术保证。
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